中国农业大学现有本科生1.46万余人。目前设有覆盖农学、理学、工学、经济学、管理学、法学和文学等7个学科门类共80个本科专业，并设有11个第二学士学位专业。学校持续深化新农科新工科新文科建设，不断优化专业布局，突出交叉融合，在全国首创生物育种科学、农业智能装备工程、兽医公共卫生、社会政策等6个本科专业，新增人工智能、数据科学与大数据技术等新型新兴本科专业。
学校的本科教育坚持“德才兼备、全面发展、通专平衡、追求卓越”的人才培养理念，培养德智体美劳全面发展，具有宽厚的人文与自然科学基础、扎实的专业知识与实践技能、富有创新精神与能力、厚植“三农”情怀的拔尖创新人才和行业领军人才，办学质量和办学水平得到了社会各界的广泛认可。
学校注重个性化的人才培养。通过打造拔尖计划2.0、强基计划、理科试验班等多元人才培养特区，构建本研衔接人才培养模式，建立本科导师制，实施自由宽松的转专业政策，全覆盖组织本科生科技创新活动，开展一对一学业指导等方式，促进了各类创新性人才和个性化人才的脱颖而出。
学校重视本科生的国际交流。学校与美国的康奈尔大学等6所著名的国外高校实施了本科生联合培养项目；与美国加州大学戴维斯分校、日本东京农业大学等国外高校开展了多种形式的学习交流项目。
学校围绕“立德树人”根本任务，坚持“以人为本”，着力构建完善的学生发展服务体系，促进学生和谐发展和全面成长。学校建立了“奖、助、贷、勤、补、免”六位一体的学生资助工作体系，保障家庭经济困难学生顺利完成学业，激励学生学有所长、追求卓越。
学校重视学生综合素质的培养。每年组织9000余名同学参与社会实践，依托urp（大学生科研训练计划）、“挑战杯”创新与创业活动、大学生领导力培养计划（英才学校）等提高学生的责任感、创新精神、创业能力和领导能力，培养知行合一的高素质人才。